Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc8D3YZV8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc8D3YZV8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms