Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo5D3YW29 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms