Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptprz1B9EKR1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms