Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmf1B9EKI3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms