Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms