Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20547B8JJN0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20547B8JJN0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms