Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf11cB4XVP9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms