Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms