Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud7bB2RUR8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud7bB2RUR8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms