Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AU015836B2RUM3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms