Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a28B2RT89 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms