Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed5B2RPU8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed5B2RPU8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms