Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H60cB1B213 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H60cB1B213 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H60cB1B213 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H60cB1B213 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms