Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
AU022751B1B0V2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AU022751B1B0V2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AU022751B1B0V2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms