Protein–RNA interactions for Protein: B1AX85

6030498E09Rik, RIKEN cDNA 6030498E09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030498E09RikB1AX85 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
6030498E09RikB1AX85 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030498E09RikB1AX85 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
6030498E09RikB1AX85 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms