Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtpruB1AUH1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms