Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700084M14RikB1AT01 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700084M14RikB1AT01 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms