Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spocd1B1ASB6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms