Protein–RNA interactions for Protein: A6H584

Col6a5, Collagen alpha-5(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a5A6H584 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a5A6H584 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms