Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms