Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms