Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms