Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FocadA2AKG8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FocadA2AKG8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FocadA2AKG8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms