Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VirmaA2AIV2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VirmaA2AIV2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VirmaA2AIV2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.5 ms