Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Camsap1A2AHC3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Camsap1A2AHC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Camsap1A2AHC3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Camsap1A2AHC3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Camsap1A2AHC3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Camsap1A2AHC3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Camsap1A2AHC3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Camsap1A2AHC3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Camsap1A2AHC3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Camsap1A2AHC3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Camsap1A2AHC3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Camsap1A2AHC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Camsap1A2AHC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms