Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb4A2A863 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms