Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm2A2A7B5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm2A2A7B5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm2A2A7B5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm2A2A7B5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms