Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms