Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trav12-2A0N8N6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trav12-2A0N8N6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trav12-2A0N8N6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms