Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms