Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIF8

Irgm2, Immunity-related GTPase family M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm2A0A140LIF8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irgm2A0A140LIF8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm2A0A140LIF8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms