Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH3

AU041133, Expressed sequence AU041133, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU041133A0A0J9YVH3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AU041133A0A0J9YVH3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AU041133A0A0J9YVH3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AU041133A0A0J9YVH3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms