Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20792A0A087WRF5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20792A0A087WRF5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms