Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
4933428G20RikQ9D3X4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
4933428G20RikQ9D3X4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms