Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prm3Q62100 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prm3Q62100 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prm3Q62100 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prm3Q62100 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prm3Q62100 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prm3Q62100 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prm3Q62100 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prm3Q62100 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prm3Q62100 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prm3Q62100 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prm3Q62100 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prm3Q62100 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prm3Q62100 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prm3Q62100 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prm3Q62100 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prm3Q62100 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prm3Q62100 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prm3Q62100 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prm3Q62100 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prm3Q62100 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prm3Q62100 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prm3Q62100 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prm3Q62100 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prm3Q62100 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prm3Q62100 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prm3Q62100 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prm3Q62100 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prm3Q62100 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prm3Q62100 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prm3Q62100 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prm3Q62100 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prm3Q62100 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prm3Q62100 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prm3Q62100 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prm3Q62100 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prm3Q62100 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prm3Q62100 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prm3Q62100 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prm3Q62100 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prm3Q62100 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prm3Q62100 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prm3Q62100 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prm3Q62100 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prm3Q62100 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prm3Q62100 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prm3Q62100 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prm3Q62100 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prm3Q62100 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prm3Q62100 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prm3Q62100 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prm3Q62100 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prm3Q62100 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prm3Q62100 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prm3Q62100 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prm3Q62100 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prm3Q62100 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prm3Q62100 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prm3Q62100 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prm3Q62100 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms