Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Pole3Q9JKP7 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Pole3Q9JKP7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Pole3Q9JKP7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Pole3Q9JKP7 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Pole3Q9JKP7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Pole3Q9JKP7 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Pole3Q9JKP7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Pole3Q9JKP7 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Pole3Q9JKP7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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