Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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