Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms