Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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