Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Fcf1Q9CTH6 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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