Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ncbp2Q9CQ49 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms