Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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