Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms