Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms