Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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