Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms