Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ubash3bQ8BGG7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ubash3bQ8BGG7 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ubash3bQ8BGG7 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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