Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms