Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms