Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ckap2lQ7TS74 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ckap2lQ7TS74 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms